本週大綱
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- 一般
The
goal of this course is to instruct students in the use of bioinformatics tools
for biology and aquaculture problem-solving. Students in the course will learn
about relevant bioinformatic principles as well as how to use a variety of
applications for bioinformatic analysis. We will discuss tools and techniques
using biological data for bacterial genomics, metagenomics, transcriptomics,
and species identification. Using a web-based analytical tool, the course will
mix academic lectures with practical tasks. Online tools for analyzing and
interpreting molecular data will be available to the students.
- 1. 02月 17日 - 02月 23日
Introduction to bioinformatics
- 2. 02月 24日 - 03月 2日
Application of bioinformatics to various
field
- 3. 03月 3日 - 03月 9日
Integration of biological data
- 4. 03月 10日 - 03月 16日
Practical application of Bioinformatics in
aquaculture research
- 5. 03月 17日 - 03月 23日
Tools for similarity search and sequence alignment
- 6. 03月 24日 - 03月 30日
Alignment of multiple sequences
- 7. 03月 31日 - 04月 6日
Introduction_to_sequencing_and_ONT_Part 1
- 8. 04月 7日 - 04月 13日
Introduction_to_sequencing_and_ONT_Part 2
- 9. 04月 14日 - 04月 20日
Mid-Term Week- Examination
- 10. 04月 21日 - 04月 27日
Bacterial genome annotation- A case study
- 11. 04月 28日 - 05月 4日
Bacterial Virulence determination using fish bacterial genome sequence
- 12. 05月 5日 - 05月 11日
Metagenomics and its application to microbiome
- 13. 05月 12日 - 05月 18日
Diversity index analysis in microbial population
- 14. 05月 19日 - 05月 25日
Introduction to transcriptome analysis
- 15. 05月 26日 - 06月 1日
Student presentation - research paper discussion
- 16. 06月 2日 - 06月 8日
Student Hands-on training to analyse bacterial genome_group_1
- 17. 06月 9日 - 06月 15日
Students_Hands-on training to analyse metagenomics using online resources
- 18. 06月 16日 - 06月 22日