Weekly outline

    《尊重智慧財產權,請使用正版教科書,勿非法影印書籍及教材,以免侵犯他人著作權》

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  • 1. 8 September - 14 September

    課程介紹

    課程大綱簡介、學生需求調查

    • 2. 15 September - 21 September

      數據的生命週期與描述性統計

      統計在研究中的角色。介紹 Google Sheets 環境。數據整理 (Tidy Data) 的重要性;平均值、中位數、標準差(SD)、標準誤(SEM) 的概念與計算。

      Workshop: 練習整理一份混亂的資料 Google Sheets 中使用 AVERAGE, MEDIAN, STDEV, COUNT 等函數計算統計量。

      • 3. 22 September - 28 September

        數據視覺化

        視覺化為何重要?各類圖的適用時機。

        Workshop: 在 Google Sheets 中從原始數據製作出帶有 SEM 誤差線的長條圖。

        • 4. 29 September - 5 October

          老師請假於健康大數據年會演講,請同學瀏覽會議演講影片課程內容有關。

          • 5. 6 October - 12 October

            國慶日(放假)

            • 6. 13 October - 19 October

              假說檢定的邏輯 & t-test

              從問題到假說。虛無假說 (H0​) 與對立假說 (H1​)。P-value 的直觀意義:一個介於 0 與 1 之間的「驚訝程度指標」、介紹 t-test:比較「兩組」平均值是否有顯著差異的工具。獨立樣本 t-test 的概念。

              Workshop: 在 Google Sheets 中使用 T.TEST 函數,學習輸入參數並判讀回傳的 p-value。

              • 8. 27 October - 2 November

                p-value 到結論

                何謂統計顯著性 (α = 0.05)?如何根據 p-value 與 α 的關係,做出「拒絕」或「無法拒絕」H0​ 的結論。Workshop: 提供多個 t-test 結果,讓學生練習撰寫標準的統計結論句型。

                • 9. 3 November - 9 November

                  Google Sheets 綜合演練

                  期中實作。提供一份新的數據集,要求學生從頭開始:整理數據、計算描述性統計、製作附有誤差線的長條圖、執行 t-test 並寫下完整結論。

                  • 10. 10 November - 16 November

                    安裝 R RStudio

                    為何要從 Google Sheets 轉到 R?(效率、功能、再現性)。

                    Workshop: 引導完成 R 與 RStudio 的安裝與環境設定。介紹 RStudio 介面的四個窗格、介紹程式語言的基本概念。

                    • 11. 17 November - 23 November

                      R 的基本語法與物件

                      變數賦值 (<wink、向量 (c())、讀取外部資料 (read.csv)。Workshop: 練習基本指令,並成功將先前在 Google Sheets 使用的 資料下載為CSV 檔案後讀入 R。

                      • 12. 24 November - 30 November

                        R 重現描述性統計

                        在 R 中使用 mean(), sd() 等函數。介紹 summary() 函數的便利性。Workshop: 使用 R 計算先前數據集的描述性統計,並與 Google Sheets 的結果比對,建立信心。

                         

                        • 13. 1 December - 7 December

                          R 重現 t-test

                          在 R 中使用 t.test() 函數。學習公式語法 (y ~ x)。Workshop: 用 R 重新執行一次 t-test,確認能得到與 Google Sheets 相同的 p-value,並學會解讀 R 的輸出格式。

                          • 14. 8 December - 14 December

                            數據視覺化:ggplot2 初探

                            介紹 ggplot2 的圖層語法概念。Workshop: 使用 ggplot2 繪製先前數據的長條圖與箱形圖,體會其彈性與強大。

                            • This week

                              15. 15 December - 21 December

                              ANOVA 的時機:當比較超過兩組

                              為何不能一直做 t-test?多重比較問題。介紹變異數分析 (ANOVA) 的核心思想:比較組間變異與組內變異。One-way ANOVA 的適用條件與其假說。

                              Workshop: 在 R 中使用 aov() 函數執行單因子變異數分析,並使用 summary() 查看結果。

                              • 16. 22 December - 28 December

                                詮釋 ANOVA 結果 &事後檢定

                                如何從 ANOVA 表中找到 F-statistic 與 p-value?如果 p < 0.05,它只告訴我們「至少有兩組之間存在差異」,但沒說是誰。需進行事後檢定。介紹 Tukey's HSD (Honestly Significant Difference) test

                                • 17. 29 December - 4 January

                                  期末專案報告

                                  期末實作。提供一份包含三組以上的數據集。要求學生使用 R 從頭分析到尾:數據匯入、執行 ANOVA、必要時做 Tukey 檢定、繪製最終圖表,並撰寫一段完整的結果詮釋。

                                  • 18. 5 January - 11 January

                                    真實生物統計數據分析實戰

                                    實際使用真實世界醫療數據(模擬數據)進行分析示範整套生物資訊分析者的操作流程。