本週大綱
《尊重智慧財產權，請使用正版教科書，勿非法影印書籍及教材，以免侵犯他人著作權》
【瀏覽課程大綱Syllabus】【列印Print】
- 一般
The
goal of this course is to instruct students in the use of bioinformatics tools
for biology and aquaculture problem-solving. Students in the course will learn
about relevant bioinformatic principles as well as how to use a variety of
applications for bioinformatic analysis. We will discuss tools and techniques
using biological data for bacterial genomics, metagenomics, transcriptomics,
and species identification. Using a web-based analytical tool, the course will
mix academic lectures with practical tasks. Online tools for analyzing and
interpreting molecular data will be available to the students.
- 1. 02月 19日 - 02月 25日
Introduction to bioinformatics
- 2. 02月 26日 - 03月 3日
Application of bioinformatics to various
field
- 3. 03月 4日 - 03月 10日
Integration of biological data
- 4. 03月 11日 - 03月 17日
Practical application of Bioinformatics in
aquaculture research
- 5. 03月 18日 - 03月 24日
Tools for similarity search and sequence alignment
- 6. 03月 25日 - 03月 31日
Alignment of multiple sequences
- 7. 04月 1日 - 04月 7日
Introduction_to_sequencing_and_ONT_Part 1
- 8. 04月 8日 - 04月 14日
Introduction_to_sequencing_and_ONT_Part 2
- 9. 04月 15日 - 04月 21日
Mid-Term Week- Examination
- 10. 04月 22日 - 04月 28日
Bacterial genome annotation- A case study
- 11. 04月 29日 - 05月 5日
Bacterial Virulence determination using fish bacterial genome sequence
- 12. 05月 6日 - 05月 12日
Metagenomics and its application to microbiome
- 13. 05月 13日 - 05月 19日
Diversity index analysis in microbial population
- 14. 05月 20日 - 05月 26日
Introduction to transcriptome analysis
- 15. 05月 27日 - 06月 2日
Student presentation - research paper discussion
- 16. 06月 3日 - 06月 9日
Student Hands-on training to analyse bacterial genome_group_1
- 17. 06月 10日 - 06月 16日
Students_Hands-on training to analyse metagenomics using online resources
- 18. 06月 17日 - 06月 23日