環境有機化學主要目的為使同學瞭解有機污染物質的分類、官能基、與基本性質，藉由其反應原理及衍生物，探討有機污染物質在自然環境與人為條件中可能進行的降解、轉變、轉移與傳輸過程，以增進同學於調查、分析或處理環境有機污染物質時的認識。本課程將著重於介紹環境中有機污染物質之(1)分類與相關特性、(2)基本反應原理、(3)環境宿命。其中(1)分類與相關特性: 包括有機物質的分類、物理化學性質、蒸氣壓、水中溶解度與活性係數、分配係數(空氣與水之間、有機溶劑與水之間)、生物累積、擴散、吸附與脫附作用。(2)基本反應原理:水解作用(水解動力、水解反應機制、親核取代、催化作用)、還原作用(還原性轉換反應、還原動力)、環境氧化作用(氧分子、過氧化氫、表面氧化反應、熱氧化)、與清潔劑之作用、光化學反應(直接光解、間接光解)、生物性轉換反應。(3)環境宿命:碳循環、有機物質轉移、液氣固相對有機物質之影響。