本課程討論地表所有淡水水域之物理、化學、地質、生態及生物特性，以湖沼為主，而河川及河口均在討論之範圍內。由於魚池亦為淡水水體，雖然其面積及深度均較小，但其水質之物、化性質及生態環境與天然淡水水體亦有類似之處，是故亦加以討論。湖沼學可視為淡水養殖之基礎課程之一。由於水中之許多生物都可作為養殖對象，因此對這些水族及其生存環境之瞭解，有助於學生對養殖技術之提升。