碩士論文是學生必修課程之一，在指導教授選定論文題目並進行撰寫，經口試及格後，才能取得碩士學位。本系碩士班之主要研究之題包括：景觀設計，景觀規劃、農業發展政策、生態旅遊、休閒農業…等。