本課程之目的，在使學生瞭解森林生態系其實存在著豐富的物種，除了地上部植群動物外，其實還有著扮演生態系極重要地位的微生物。這些肉眼看不見的微生物包括原核生物細菌和真核生物真菌主宰環境裡養分的循環。此外，更與植群有著密不可分的關係包括固氮菌、菌根菌、腐生菌甚至是引起森林危害的病原菌等。近來更有研究指出，森林裡的大氣中也存在著所謂的氣生微生物，對於其生態功能也是未知。此課程將介紹真核和原核生物的細胞構造和演化、分類和已知的生態功能。希望藉由此課程可以讓學生更了解森林微生物的重要性。