本課程主要教授病原菌(原核性細菌、菌質、真菌、線蟲等)在植物上造成病害之原理，並進一步說明寄主與病原間之相互關係及植物抗病之原理。同時，為了有效防治病害的發生，課程中除了闡明環境因素與病勢發展之關係外，也根據目前殺菌劑的類別與生物防治的做法有系統性的介紹。